（三）教授會制度與改革

  作為大學治理政策的目標之一，長期以來日本國立大學一直奉行「教授會自治」模式。原來的《學校教育法》規定：「大學為審議重要事項，必須設立教授會。」在國立大學法人化之前，依據《教育公務員特例法》，學院教授會對院長選聘、教師人事、勤務評定等權限具有重要影響。近年來，伴隨著國立大學治理改革的不斷深入，「教授會的過大權限」經常被指為「諸惡之源」[24]。自民黨日本經濟再生本部在其《大學治理改革的建議》中認為，由於管理層與教授會的職能分擔、決策程序不明確，領導層對校內事務管理權限不明確，導致教授會在預算分配、人事等多方面具有決策權，由此使校長難以真正發揮領導力。然而，教授會並不是事實上的決策機關。為明確作為校長諮詢機關的位置，學校基本法93條應該修改為「作為教育研究相關的校長諮詢機關，大學中設置教授會」。2014年中央教育審議會提出的《關於推動大學治理改革》[25]中，取代「學問自由」「大學自治」等憲法精神和制度，著重強調「構建校長領導下的戰略性大學管理的治理體制」。即引進公司治理的基本理念，通過發揮校長的領導力，要消除作為抵抗勢力的教授會制約。

  2015年，日本修改《學校教育法》，將原來的「大學為審議重要事項必須設置教授會」（93條第一項）修改為「大學設立教授會」（93條第一項），「教授會對校長關於學生入學、畢業、課程修了、學位授予的決定陳述意見。對於除此職位的其他教育研究重要事項，校長在做出決定時必須聽取教授會意見」。副教授及其他職員可以參加教授會。

  國立大學的教授會是指由全體教師組成的全校教授會、學院教授會、研究科教授會、專業教授會等。此外還有教育課程制定委員會、教師人事委員會等按照機能劃分的教授會組織。其中學院教授會影響最大。大學自治的宗旨在於排除公權力對大學的不當干預。對於大學管理範疇中的某些事項，並不意味著必須由學院所有教師參與決策。

  教授會作為由擁有專門知識的教師組成的合議制審議機關，根據學校教育法和國立大學法人法，教授會主要負責審議的重要事項包括：（1）教育課程制定；（2）學生身份審查；（3）授予學位；（4）審查教師研究業績等。在充分考慮教授會意見的基礎上，校長擁有最終決定權。根據2013、2014年《學校法人經營改善政策問卷調查》，在日本的大學中，45.6%的教學計劃等由教授會決策，35.6%的教師人事權由教授會決定。教授會對大學管理層的決策權則影響較小。教授會正在日益成為名副其實的教育研究諮詢機構。